当公司账户因劳动仲裁被冻结时，可以采取以下步骤来申请解冻：

一、全面梳理案件情况

首先，要详细了解员工申请劳动仲裁的具体事由，如工资拖欠、违法解除合同等，并对照公司的证据材料，评估责任归属。这一步是后续采取行动的基础。

二、评估冻结的合理性

如果公司认为账户冻结不合理或存在误冻的情况，可以向法院提出复议申请。在申请时，需要准备充分的证据，如已支付相关款项的凭证、不存在侵权行为的证明等，以说明账户冻结对公司正常经营产生的重大影响，并请求法院审查并解除冻结。

三、积极与对方协商

在劳动仲裁过程中，尝试与申请仲裁的员工进行沟通，寻求双方都能接受的解决方案。如果达成和解协议，可以请求对方撤回仲裁申请或向法院申请解除冻结。这是一种较为快捷且成本较低的解冻方式。

四、提供担保申请解冻

根据《民事诉讼法》的相关规定，公司可以提供现金、房产等担保物，向法院申请解除冻结。这种方式需要公司有一定的资产作为担保，但可以有效地解除账户冻结，恢复公司正常运营。

五、严格遵守法律规定与仲裁程序

无论采取何种方式解冻，公司都应严格遵守法律规定和仲裁程序。按要求提交答辩状、证据等材料，按时参加仲裁庭审。如果最终仲裁裁决公司承担责任，应及时履行义务，避免产生更多法律风险与不利后果。履行完毕后，可申请解除账户冻结。

六、关注账户解冻后的运营

即使账户成功解冻，公司也应关注后续的运营情况。确保资金流转顺畅，及时与合作伙伴和客户沟通，消除因账户冻结可能带来的疑虑和不良影响。

综上所述，公司账户因劳动仲裁被冻结时，应通过全面梳理案件情况、评估冻结的合理性、积极与对方协商、提供担保申请解冻以及严格遵守法律规定与仲裁程序等步骤来申请解冻。同时，也要关注账户解冻后的运营情况，确保公司能够恢复正常运营。