在进行公司股权变更时，确实会涉及到多种税收。以下是您需要了解的主要税种及其相关规定：
印花税：
- 股权转让的双方（转让方与受让方）均需缴纳。
- 税率按股权转让协议所载金额的万分之五计算，并自2018年5月1日起享受减半征收的优惠政策。
个人所得税：
- 适用于个人股权转让方。
- 税率固定为20%。
- 应纳税所得额是股权转让收入减去股权原值和合理费用（如印花税、公证费等）后的余额。
企业所得税：
- 适用于企业股权转让方。
- 税率一般为25%，但符合条件的小型微利企业等可享受税收优惠政策，税率可能降至20%或更低。
- 应纳税所得额是股权转让收入扣除股权成本后的余额，不得扣除被投资企业的未分配利润等留存收益。
增值税（特殊情况）：
- 主要针对上市公司股权（股票）的转让。
- 税率根据卖出价扣除买入价后的余额计算，税率为6%；小规模纳税人适用3%的征收率（具体税率可能因政策调整而有所变化）。
- 计算方式为正负差相抵后计算销售额，年末负差不得转入下一个会计年度。
在处理股权变更的税务问题时，还需注意以下几点：
- 税务稽查风险：股权转让价格若明显偏低且无正当理由，或未依法申报纳税，将可能引起税务机关的关注和稽查。
- 及时申报纳税：股权变更完成后，应准确计算应纳税额，并严格按照税法规定的期限和程序进行纳税申报和税款缴纳，以避免潜在的税务风险。
- 专业咨询：鉴于股权变更涉及复杂的税务问题，建议在进行此类操作前咨询专业的税务顾问或律师，如您在此过程中有任何疑问或需要进一步的法律支持，请随时向我咨询。
综上所述，股权变更涉及的税务问题需根据具体情况仔细分析，并确保所有相关税种得到正确处理，以维护双方的合法权益并避免不必要的税务风险。