城中村改造补偿和棚户区补偿的主要区别体现在以下几个方面：

1. 补偿标准的差异：

   • 城中村改造补偿：通常根据房屋的建筑材料和使用用途来确定补偿标准。一般来说，商业用途的补偿标准高于一般住房。补偿方式可能包括货币补偿和产权置换，货币补偿往往参照同地段商品房价格进行。
   • 棚户区改造补偿：主要分为现金补偿和房屋置换两种方式。房屋置换的补偿可能包含1:1的面积置换、房屋重置成新价格（考虑房屋的新旧、装修、结构）以及其他搬迁奖励。棚户区改造的补偿标准相对较低，按照当地拆迁补偿标准执行。

2. 土地性质的差异：

   • 城中村改造：涉及的土地通常是集体土地，居民户籍多为农村户口。因此，在补偿时需要考虑土地使用权和房屋产权的特殊性。
   • 棚户区改造：涉及的土地可能是国有土地或集体土地，但补偿时往往参照国有土地上房屋征收补偿的标准进行。

3. 改造程序和强制性的差异：

   • 城中村改造：通常遵循自愿原则，需要百分之百的业主同意方可拆除动工。
   • 棚户区改造：因涉及公共安全利益，对于少数不服从改造的，可以通过行政征收、行政处罚程序等强制执行。

4. 配建要求的差异：

   • 城中村改造：按规定比例配建，无全部配建保障房的要求，可建商品房。
   • 棚户区改造：除满足拆迁安置需要外，其余住房均配建为人才住房和保障型住房，且坚持以租为主。

综上所述，城中村改造补偿和棚户区补偿在补偿标准、土地性质、改造程序及强制性、配建要求等方面存在显著差异。如果您在具体案件中遇到相关问题，可以直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供更详细的法律分析和建议。