针对您提出的“新生儿上户口妈妈跑了怎么办”的问题，首先请不要过于担心，这种情况虽然有些复杂，但还是有解决的办法的。以下是我为您提供的详细解答和建议：
一、了解上户口的基本要求和流程
根据相关规定，新生婴儿出生后一个月内，应由父亲、母亲或其他监护人凭相关材料向父亲或母亲户口所在地公安派出所申报出生登记。这些材料通常包括：
- 《出生医学证明》
- 父母双方的居民户口簿
- 结婚证（如为婚生子女）
- 居民身份证
- 非婚生育说明（如为非婚生育）
如果母亲不在场，可以由父亲或其他监护人代为办理，但需要确保提供的材料齐全且真实有效。
二、针对母亲不在场的情况
确认母亲身份和意愿：
- 如果母亲因某种原因无法到场，但同意孩子上户口，可以尝试通过电话或视频通话等方式确认其身份和意愿，并记录下相关证据。
- 如果母亲失联或不同意上户口，情况会相对复杂，需要寻求法律援助或咨询当地派出所了解具体处理办法。
准备替代材料：
- 如果无法获得母亲的居民户口簿或居民身份证，可以尝试提供其他能够证明母亲身份的材料，如结婚证、亲子鉴定证明等。
- 对于非婚生育的情况，需要提供非婚生育说明和亲子鉴定证明。
咨询当地派出所：
- 由于不同地区的户籍管理政策可能存在差异，建议您在办理前咨询当地派出所或户籍管理部门，了解具体的办理要求和流程。
- 派出所工作人员会根据您的具体情况给出相应的指导和建议。
三、注意事项
- 确保材料真实有效：提供的所有材料必须真实有效，否则可能会影响户口的办理进度或结果。
- 及时办理：新生儿上户口有一定的时间限制（通常是一个月内），建议您尽快办理，以免错过最佳办理时机。
- 保持沟通：在办理过程中，如果遇到任何问题或困难，及时与当地派出所或户籍管理部门沟通，寻求帮助和解决方案。
总之，虽然母亲不在场可能会给新生儿上户口带来一些困难，但只要您按照相关规定和要求准备材料，并咨询当地派出所了解具体办理流程，还是可以顺利完成户口办理的。希望我的解答能够对您有所帮助！