施工许可证超期未延续或重新申领的，其后果是施工许可证自行废止。具体来说：
法律依据：根据《建筑工程施工许可管理办法》第八条，建设单位应当自领取施工许可证之日起三个月内开工。因故不能按期开工的，应当在期满前向发证机关申请延期，并说明理由；延期以两次为限，每次不超过三个月。既不开工又不申请延期或者超过延期次数、时限的，施工许可证自行废止。
实际影响：
- 项目停工：施工许可证废止后，如果项目尚未完工，将不得不停止施工。这可能导致工程进度延误，增加建设成本，甚至可能引发与施工方、供应商等的合同纠纷。
- 行政处罚：根据相关法律法规，未取得施工许可证擅自施工的，或者施工许可证废止后仍继续施工的，可能会受到相关行政部门的处罚，如罚款、责令停工等。
- 信誉损失：施工许可证超期未处理可能导致建设单位在业界的信誉受损，影响其后续项目的开展和合作。
建议措施：
- 及时续期：如果因故不能按期开工，应在施工许可证有效期满前及时向发证机关申请延期，并说明合理的理由。
- 重新申领：如果施工许可证已经废止，且项目仍需继续施工，应尽快按照相关规定重新申领施工许可证。
- 法律咨询：在处理施工许可证超期问题时，建议咨询专业律师，以确保合规操作，避免不必要的法律风险。
总之，施工许可证是建筑工程合法施工的重要凭证，建设单位应密切关注其有效期，并在必要时采取相应措施以确保项目的顺利进行。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。