所得税年报中的特别纳税调整，指的是企业与其关联方之间的业务往来，不符合独立交易原则而减少企业或者其关联方应纳税收入或者所得额的，税务机关有权按照合理方法调整。具体来说，这主要涉及到以下几个方面：

1. 关联交易调整：如果企业与关联方之间的交易价格、费用分摊等不符合市场独立交易原则，税务机关可能会对这些交易进行调整，以确保税收的公平性。例如，如果企业以低于市场价格向关联方销售商品，税务机关可能会按照市场价格重新计算应纳税额。

2. 资本弱化调整：企业从其关联方接受的债权性投资与权益性投资的比例超过规定标准而发生的利息支出，可能不得在计算应纳税所得额时扣除。这是为了防止企业通过资本弱化的方式减少税收。

3. 受控外国企业调整：如果企业控制的外国企业设立在低税率国家，且该外国企业的利润未合理分配给企业股东，那么税务机关可能会对该外国企业的利润进行特别纳税调整，以防止税收逃避。

4. 一般反避税调整：对于其他不符合税收法律法规的避税行为，税务机关也有权进行特别纳税调整。这主要是为了打击各种形式的税收逃避和滥用税收协定等行为。

在进行特别纳税调整时，税务机关会遵循一定的程序和方法，确保调整的合理性和公正性。如果企业对调整有异议，可以依法申请行政复议或提起行政诉讼。同时，企业也应该加强自身的税收合规管理，避免不必要的税收风险。