如果摩托车没有按时申领检验合格标志，将会面临一定的处罚。根据相关规定，摩托车自注册登记之日起，在特定的年份（如第6年、第10年）需要进行安全技术检验，并在10年内每两年向公安机关申领检验标志。这是确保车辆安全、合法上路行驶的重要步骤。

具体来说，如果摩托车属于免检范围，即注册登记10年以内的非营运车辆，并且没有发生任何伤人交通事故，也不存在非法改装被依法处罚的交通违法行为，那么车主仍然需要按照相关规定，在机动车检验有效期止前3个月内，通过“交管12123”APP或前往交管部门窗口申领免检合格标志。

如果未能按时申领，根据道路交通安全法的相关规定，车辆将可能被视为未按规定进行安全技术检验，进而可能面临罚款、扣分等处罚措施。此外，如果车辆因此发生交通事故，保险公司也可能拒绝赔付相关损失。

因此，为了确保摩托车的合法上路行驶和避免不必要的处罚，车主应密切关注车辆的检验有效期，并按时申领检验合格标志。如果因故未能按时申领，应尽快前往交管部门补办相关手续，以确保车辆的合法性和安全性。