摩托车没有合格证被交警查获，将会面临一系列的法律后果。具体来说：

1. 罚款与拘留：

   • 依据相关法律规定，摩托车若未携带或无法出示有效合格证，在被交警部门查获后，驾驶人员可能面临由公安机关交通管理部门所作出的二百元至二千元以下的罚款处罚。
   • 同时，驾驶人员也可能会被处以十五日以下的行政拘留。

2. 车辆处理：

   • 被查获的摩托车，若驾驶人员、所有权人或管理者在规定的期限内（如三十日内）未能及时补办相应手续或未主动到场接受处理，公安机关交通管理部门在履行完相关通知和公示程序后，有权依法将该摩托车送交具有资质的拍卖机构进行公开拍卖，所得收益将全额上缴国家财政。

3. 法律责任：

   • 驾驶摩托车未携带合格证的行为，不仅违反了道路交通安全法的相关规定，也构成了对交通管理秩序的扰乱。因此，驾驶人员需承担相应的法律责任。

为了避免上述法律后果，建议摩托车驾驶人员在驾驶前务必检查车辆是否携带了有效的合格证。若合格证遗失或损坏，应尽快到相关部门补办或更换。同时，也要遵守交通安全法规，确保行车安全。

如果你还有其他关于摩托车驾驶或交通法规方面的问题，可以直接向我咨询，我会尽我所能为你提供帮助。