在合同纠纷案件审理中，确实会遇到诸多疑难问题，这些问题往往涉及合同效力、工程质量、工期延误、工程款结算等多个方面。以下是对这些常见疑难问题的详细分析：
一、合同效力问题
未取得相应资质或超越资质等级签订合同：
- 分析：根据《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释（一）》第一条，承包人未取得或超越资质等级签订的合同无效。
- 影响：合同无效后，工程价款的支付等约定可能无法按原合同履行，但工程经竣工验收合格的，承包人可请求参照合同约定支付工程价款。
借用资质签订合同（挂靠）：
- 分析：无资质的实际施工人借用有资质企业名义签订的合同也无效。
- 影响：实际施工人与被挂靠企业可能对工程质量等问题承担连带责任。
二、工程质量问题
质量不符合约定：
- 分析：若工程质量不符合合同约定，发包人有权要求承包人承担修理、返工等责任。
- 处理：因承包人原因导致质量问题给发包人造成损失的，承包人还应承担赔偿责任。
未经竣工验收擅自使用：
- 分析：根据司法解释，建设工程未经竣工验收，发包人擅自使用后，又以质量不符合约定为由主张权利的，一般不予支持，但承包人仍需对地基基础工程和主体结构质量负责。
三、工期延误问题
开工日期和竣工日期的认定：
- 分析：开工日期通常以开工通知为准；竣工日期则根据不同情况有不同认定标准，如竣工验收合格之日、提交验收报告之日等。
工期延误责任的划分：
- 分析：工期延误可能由发包人、承包人或不可抗力因素导致，需根据具体情况判断责任归属。
四、工程款结算问题
工程量争议：
- 分析：工程量确定是工程款结算的关键，当双方对工程量存在争议时，应按照施工过程中形成的签证等书面文件确认。
- 处理：工程量争议较大时，可能需要通过司法鉴定来确定。
工程价款利息计算：
- 分析：利息从应付工程价款之日开始计付，利率标准有约定的按约定处理，没有约定的按同期同类贷款利率或贷款市场报价利率计息。
五、其他常见问题
优先受偿权问题：
- 分析：承包人对建设工程价款享有优先受偿权，但行使有一定的期限限制，且优先受偿的范围不包括逾期支付建设工程价款的利息、违约金等损失。
实际施工人权益保护：
- 分析：实际施工人可以向转包人、违法分包人主张权利，也可以将发包人列为被告，要求发包人在欠付工程款范围内承担责任。
综上所述，合同纠纷案件审理中的疑难问题涉及多个方面，需要综合考虑合同约定、法律法规以及实际情况进行判断和处理。如有具体案件或问题，可进一步向我咨询，我将结合您的具体情况提供更具针对性的法律建议。