货运车辆交警中队可以处理违章。交警中队作为公安机关交通管理部门的一部分，具有处理交通违章的职权。具体来说：

1. 职权范围：交警中队负责维护辖区内的道路交通秩序，对交通违法行为进行查处是其主要职责之一。无论是货运车辆还是其他类型的车辆，只要存在交通违章行为，交警中队都有权进行处理。

2. 处理流程：当货运车辆发生违章行为时，交警中队会依据相关法律法规进行查处，包括但不限于现场执法、调查取证、作出处罚决定等。如果违章行为需要罚款或扣分，交警中队也会按照相关规定执行。

3. 法律依据：根据《中华人民共和国道路交通安全法》等法律法规，公安机关交通管理部门负责道路交通安全管理工作，交警中队作为其下属机构，有权处理交通违章行为。

综上所述，货运车辆交警中队确实可以处理违章。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律咨询，可以直接向我提问。