透支卡长时间不用，一般不会自动注销。具体分析如下：

1. 银行政策差异：不同的银行对于透支卡（通常指信用卡）的注销政策有所不同。大多数银行不会因为长时间不使用就自动注销用户的透支卡，除非用户主动申请注销或银行因特定原因（如用户严重违约）而决定注销。

2. 年费与费用：需要注意的是，即使透支卡长时间不用，某些银行可能会继续收取年费或其他相关费用。如果费用长期未支付，可能会导致账户欠费，进而影响用户的信用记录。因此，建议用户定期检查账户状态，避免因未支付费用而产生不必要的麻烦。

3. 安全考虑：长时间不使用的透支卡也可能存在安全风险，如被盗刷或滥用。因此，如果用户确定不再使用某张透支卡，最好主动联系银行进行注销，以确保账户安全。

4. 特殊规定：部分银行可能对于长时间未激活或未使用的透支卡有特别规定，如在一定时间内未使用则自动转为休眠状态或降低信用额度等。因此，建议用户在使用透支卡前仔细阅读银行的相关政策和规定。

综上所述，透支卡长时间不用一般不会自动注销，但用户应根据自己的实际情况和银行政策来决定是否继续保留或使用透支卡。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。