退休人员扣缴大额医保的原因主要是大额医疗费用补助是基本医疗保险的补充。当职工医保参保人在自然年度内基本医疗保险住院费用报销超过一定数额（例如昆明市为8万元）时，将自动进入大额医疗费用补助报销范围，这也就是市民常说的“大病保险”。

大额医疗费用补助由单位和个人共同缴纳，对于灵活就业人员，则按规定由个人缴纳。退休后，虽然职工不再为单位工作，但大额医疗费用补助的保障仍然继续，因此单位及个人（或仅个人，对于灵活就业人员）仍需要缴纳这部分费用。

具体来说，退休后的大额医保费用可以从医保个人账户中抵扣。以昆明市为例，自2023年6月起，参加昆明市职工医保的退休人员可以使用医保个人账户来缴纳大病保险，这样就不需要再单独向税务局申报缴费。对于不愿意从个人账户划扣的退休人员，可以选择到参保地医保经办机构办理确认后，恢复税务征收方式缴费。

总的来说，退休人员扣缴大额医保是为了保障他们在面临大额医疗费用时能够获得额外的补助，减轻经济负担。这是基本医疗保险制度的一项重要补充，也是保障退休人员医疗权益的重要举措。