工资超过5000元的部分需要依法缴纳个人所得税，税额的计算涉及多个因素，包括应纳税所得额、适用的税率以及速算扣除数。以下是对这一过程的详细解释：

一、确定应纳税所得额

应纳税所得额是计算个人所得税的基础，其计算公式为：

应纳税所得额 = 综合所得收入额 - 免征额 - “三险一金”等专项扣除 - 专项附加扣除 - 依法确定的其他扣除 - 符合条件的公益慈善事业捐赠

其中：

• 综合所得收入额：通常指工资、薪金所得，需减去当月的免税收入。
• 免征额：目前为每年60000元，平均到每月即5000元。
• “三险一金”等专项扣除：包括个人缴纳的基本养老保险、基本医疗保险、失业保险和住房公积金。
• 专项附加扣除：涵盖子女教育、继续教育、大病医疗、住房贷款利息、住房租金、赡养老人以及3岁以下婴幼儿照护等七项支出。
• 依法确定的其他扣除：如个人缴付的企业年金、职业年金，以及购买商业健康保险、税收递延型商业养老保险的支出等。
• 符合条件的公益慈善事业捐赠：个人对教育、扶贫、济困等公益慈善事业的捐赠，可以在一定额度内从应纳税所得额中扣除。

二、查找适用的税率和速算扣除数

我国个人所得税采用七级超额累进税率，税率从3%至45%不等。根据计算出的应纳税所得额，可以在税率表中找到对应的税率和速算扣除数。

三、计算应纳税额

最后，使用以下公式计算应纳税额：

应纳税额 = 应纳税所得额 × 适用税率 - 速算扣除数

示例：

假设小张每月工资收入为10000元，“三险一金”专项扣除为1000元，有一个子女正在接受全日制学历教育可享受每月1000元的专项附加扣除，没有其他扣除项目。那么：

• 每月应纳税所得额 = 10000 - 5000 - 1000 - 1000 = 3000元
• 根据税率表，3000元对应的税率为3%，速算扣除数为0。
• 因此，每月应纳税额 = 3000 × 3% - 0 = 90元

需要注意的是，个人所得税通常由扣缴义务人（如单位）按月或按次预扣预缴税款。年度终了后，纳税人还需办理汇算清缴，以确保全年税额的多退少补。

综上所述，个人所得税的计算涉及多个扣除项目和税率级次，建议纳税人在实际操作中仔细核对各项扣除，并咨询专业税务人员或使用税务相关软件以确保准确合规地缴纳税款。