通行费发票没有抵扣时限。根据《国家税务总局关于取消增值税扣税凭证认证确认期限等增值税征管问题的公告》（国家税务总局公告2019年第45号）的规定，增值税一般纳税人取得2017年1月1日及以后开具的增值税专用发票、海关进口增值税专用缴款书、机动车销售统一发票、收费公路通行费增值税电子普通发票，已经取消了认证确认、稽核比对、申报抵扣的期限。因此，对于通行费发票而言，不再存在抵扣时限的问题。

这一政策调整意味着，纳税人可以在更灵活的时间内处理其增值税抵扣事宜，有助于减轻其税务管理负担，并提高其资金使用的灵活性。不过，虽然抵扣时限已经取消，但纳税人在进行抵扣时仍需确保发票的真实性和合法性，并严格按照税收法规和政策操作。