民工工资在扣除五险一金等专项扣除及专项附加扣除后，若月度收入超过5000元，则需要按照个人所得税法规定缴纳税款。以下是关于民工工资报税问题的详细解答：

一、起征点

根据《中华人民共和国个人所得税法》的规定，工资、薪金所得的个人所得税起征点为每月5000元，即年收入60000元。农民工的月工资收入在扣除各项法定扣除（如五险一金）后，若余额不超过5000元，则无需缴纳个人所得税；若超过5000元，则超出部分需依法纳税。

二、应纳税所得额的计算

应纳税所得额是计算个人所得税的基础，计算公式为：应纳税所得额 = 月度收入 - 5000元免征额 - 专项扣除 - 专项附加扣除 - 依法确定的其他扣除。

其中，专项扣除包括居民个人按照国家规定的范围和标准缴纳的基本养老保险、基本医疗保险、失业保险等社会保险费和住房公积金等；专项附加扣除则涵盖子女教育、继续教育、大病医疗、住房贷款利息、住房租金、赡养老人等支出。

三、税率与速算扣除数

个人所得税采用超额累进税率，税率范围在3%至45%之间。具体的税率表如下：

根据应纳税所得额所在的区间，可以确定相应的税率和速算扣除数，进而计算出应纳税额。应纳税额的计算公式为：应纳税额 = 应纳税所得额 × 适用税率 - 速算扣除数。

四、实际操作建议

1. 及时办理税务登记：农民工应确保自己的收入情况符合税法规定，并及时办理税务登记和申报手续。
2. 准确核算扣除项目：在计算应纳税所得额时，要准确核算各项扣除项目，以确保税款的准确性。
3. 咨询专业人士：若对税收政策或计算方法有疑问，可咨询当地税务机关或专业税务顾问，以获取准确的指导和帮助。

综上所述，民工工资在扣除各项法定扣除后，若月度收入超过5000元，则需按照个人所得税法规定缴纳税款。通过准确核算应纳税所得额和适用税率，可以确保税款的准确性和合法性。同时，农民工也应关注税收优惠政策，合理利用政策减轻税负。