港澳通行证在双休日一般是不可以办理的。根据公开信息，办理《往来港澳通行证》的时限通常为7个工作日，而受理当日、周六、日以及法定节假日是不计入工作日的。这意味着，在双休日提交申请，其办理时间将从下一个工作日开始计算。

具体来说，如果您在双休日前往办理港澳通行证，很可能会发现办理机构并未开放办理服务，因为这段时间并不计入办理的工作日之内。因此，为了确保能够顺利办理港澳通行证，建议您在法定工作日（通常指周一至周五）的工作时间内前往相关办理机构进行申请。

此外，不同地区的办理机构可能有不同的工作时间和规定，建议您在前往办理之前先查询并确认当地的具体办理时间和要求，以免因不了解情况而耽误您的办理进度。