灵活就业人员中途死亡，其缴纳的社保费用中能退还的部分主要涉及养老保险和医疗保险的个人账户余额。以下是详细解答：

1. 养老保险个人账户余额退还：

   • 灵活就业人员参加城镇职工基本养老保险后死亡，其个人账户储存额（包括本金和利息）可以依法继承。个人账户的退还金额需根据参保人的缴费基数、缴费比例及缴费年限来确定。例如，若某灵活就业人员每月按缴费基数的一定比例缴纳养老保险，其中一部分进入个人账户，累计缴费若干年后去世，其个人账户累计储存额会退还给法定继承人。
   • 具体计算公式为：个人账户退还金额 = 个人账户累计储存额（本金+利息）。这部分金额通常占个人缴费的1/3左右，剩余2/3则纳入国家统筹基金中，不可退回。

2. 医疗保险个人账户余额退还：

   • 灵活就业人员参加的职工医疗保险通常也设有个人账户，里面的资金主要来自个人缴纳的部分及按规定比例划入的部分。参保人死亡后，其医保个人账户中的余额同样可以依法继承。
   • 退还金额依据参保人的缴费情况、划入比例及缴费年限来计算。具体数额需参照当地医保政策和个人账户记录。

3. 其他保险：

   • 失业保险、工伤保险、生育保险等险种主要提供特定情况下的保障，而不是以储蓄或积累的形式存在，因此通常不涉及个人账户的退还问题。

4. 丧葬补助金和抚恤金：

   • 根据《中华人民共和国社会保险法》的规定，参加基本养老保险的个人因病或非因工死亡的，其遗属可以领取丧葬补助金和抚恤金。这两项待遇的具体标准由当地人民政府确定，并会根据经济社会发展情况适时调整。

综上所述，灵活就业人员中途死亡后，其社保费用中能退还的部分主要是养老保险和医疗保险的个人账户余额。具体退还金额需根据参保人的缴费情况、缴费年限以及当地的政策规定来确定。同时，遗属还可以按照规定领取丧葬补助金和抚恤金。如有任何疑问或需要进一步了解相关政策，请直接向我咨询。