法院判决房屋份额后，办理房产证需要遵循以下步骤：
首先，明确结论：
在法院作出判决确定了房屋份额，且该判决已经生效并完成相关法律程序后，可以办理房产证。
接下来，详细阐述办理流程：
准备相关材料：
- 生效的法院判决书：确保判决书中清晰写明了各继承人或相关当事人对房屋的具体份额以及相关的权利义务。
- 身份证明：包括身份证等有效证件。
- 若涉及委托他人办理的，还需提供授权委托书及受托人身份证明。
- 原房屋产权证书（若存在）。
向不动产登记部门提出申请：
- 前往房屋所在地的不动产登记中心。
- 填写不动产登记申请表，明确申请事项为依据法院判决办理房屋份额产权登记。
- 提交准备好的所有材料给登记部门工作人员进行初步审核。
等待审核与登记：
- 不动产登记部门会对申请进行进一步的审核，包括核实房屋产权情况等。
- 若材料无误且符合登记条件，登记部门会进行实地查看（部分情况需实地查看房屋状况）。
- 完成内部审批程序后，将房屋份额登记在申请人名下，并核发新的不动产权证书，注明各继承人或相关当事人享有的房屋份额。
注意事项：
- 在办理过程中，若遇到其他问题，如其他继承人不配合等，可能需要借助法律途径来进一步处理。
- 法院判决书不能代替房产证，因为两者性质、作用及取得程序均不同。判决书主要解决房产纠纷中的权利归属问题，而房产证是房产所有权的重要凭证。
总结：
只要判决是合法有效的，并且办理手续符合规定，一般来说是可以办理房产证的。在办理过程中，务必确保所有材料齐全、真实有效，并严格按照不动产登记部门的要求进行操作。如有任何疑问或困难，可随时向我咨询。