灵活就业社保一档次和三档次以后领养老金的差额并不是一个固定的数值，它会受到多种因素的影响，包括缴费基数、缴费年限、社会平均工资的增长率以及个人的预期寿命等。但我们可以根据一些基本的养老保险待遇计算原则来进行大致的分析。

首先，我们要明确的是，养老保险的缴费和待遇计算遵循“多缴多得，长缴多得”的原则。这意味着，在缴费年限相同的情况下，缴费基数越高，退休时领取的养老金就越多。同样，在缴费基数相同的情况下，缴费年限越长，领取的养老金也会越多。

对于灵活就业人员来说，他们可以选择不同的缴费档次作为缴费基数。一般来说，缴费基数会有多个档次可选，比如社会平均工资的60%、100%、300%等。选择不同的缴费档次，会直接影响到个人缴费的金额以及未来领取的养老金数额。

以某个具体的例子来说明，假设社会平均工资为每月6500元（这个数值会根据实际情况有所变化），按照灵活就业人员20%的费率来计算。如果选择60%的档次作为缴费基数，那么每月需要缴纳的养老保险费就是6500*60%*20%=780元；而如果选择300%的档次作为缴费基数，那么每月需要缴纳的养老保险费就是6500*300%*20%=3900元。可以看出，选择高档次缴费的金额要远高于选择低档次缴费的金额。

那么，这种缴费差异会在未来领取养老金时体现出来吗？答案是肯定的。根据养老保险待遇的计算公式，每月领取的养老金由基础养老金和个人账户养老金两部分组成。其中，基础养老金的计算公式与本人的平均缴费指数有关，而平均缴费指数就是历年缴费档位的平均值。因此，选择高档次缴费的人，其平均缴费指数会更高，从而能够领取到更高的基础养老金。

然而，需要注意的是，由于社会平均工资的不确定性以及个人预期寿命的差异等因素，我们无法精确地计算出选择不同缴费档次后未来领取养老金的具体差额。但可以肯定的是，选择高档次缴费的人在退休时能够领取到更多的养老金，从而为其退休生活提供更好的保障。

综上所述，灵活就业社保一档次和三档次以后领养老金的差额会受到多种因素的影响，但选择高档次缴费的人在退休时能够领取到更多的养老金是毋庸置疑的。因此，对于灵活就业人员来说，如果经济条件允许的话，选择较高的缴费档次是一个更为明智的选择。