民事案件调查令在特定情况下是可以涉及微信记录的，但并非所有微信记录都可被调查。根据公开发布的信息，微信取证主要围绕微信转账电子凭证进行，这包括转账记录以及与之相关的实名认证信息。这类信息可以通过特定的流程由法院向腾讯公司申请调取，并且调查结果会直接邮寄给法院案件承办法官。

然而，重要的是要注意，民事案件调查令通常不能用于调取微信通话记录和聊天记录。这意味着，除非涉及特定的转账记录或实名认证信息，否则微信中的私人通信内容通常不在调查令的调取范围内。

此外，对于微信支付的账户转账记录，法院可以通过司法专递邮寄协助调查函给财付通支付科技有限公司以获取相关信息。但如果是对支付账号进行保全冻结，则需要法院工作人员双人双证前往腾讯公司法务部办理。

总的来说，民事案件调查令能否调查微信记录取决于具体的情况和需要调取的信息类型。如果是涉及微信转账记录或实名认证信息，且符合相关法律程序和规定，那么是可以通过调查令进行调取的。但如果是私人通信内容，如聊天记录，则通常不在调查令的调取范围内。