毕业生档案不能在自己手里的原因主要基于以下几点：

首先，根据国家相关规定，档案是严禁自行携带转递的。这是为了确保档案的完整性、真实性和保密性。档案作为记录个人学习、工作经历的重要文件，具有法律效用和证明价值，需要由专门的管理机构进行妥善保管和转递。

其次，将档案拿到自己手里存在遗失的风险。个人在保管档案的过程中，可能会因为各种原因（如搬迁、遗忘等）导致档案丢失，进而给个人带来不必要的麻烦和损失。而专业的档案管理机构具备完善的保管制度和设施，能够有效避免档案的遗失。

此外，自己保管档案还可能影响个人享受相关服务。例如，在办理就业、社保、职称评审等手续时，通常需要提供档案作为证明。如果档案在个人手中，可能无法及时提供或因为不符合规定而被拒绝接受，从而影响个人权益的保障。

最后，从档案管理的专业性和规范性角度来看，由专门的管理机构进行档案管理更符合社会管理的需要。这些机构具备专业的档案管理知识和经验，能够对档案进行科学的分类、编号、装订和保管，确保档案的完整性和可追溯性。同时，它们还能够根据相关规定和程序，为用人单位和个人提供便捷的档案查询和利用服务。

综上所述，毕业生档案不能在自己手里，而应该按照国家规定转递至有人事管理权限的用人单位或相应的公共就业和人才服务机构进行管理。这样做既能够确保档案的完整性和真实性，又能够保障个人的权益和方便社会管理。