关于农行信用卡逾期2天是否会扣手续费的问题，这里需要明确的是，农行信用卡逾期费用主要包含两部分：逾期罚息和违约金。

1. 逾期罚息：这是针对当期账单内的所有消费金额，从刷卡消费的第2天起开始计算，每天按照0.05%（即万分之五）的利率计收，直到款项全部还清为止。因此，如果您的农行信用卡逾期了2天，那么从逾期的第一天开始，就会产生罚息，按照每天万分之五的比例计算。

2. 违约金：这是根据《银行信用卡章程》的规定，如果持卡人未能在到期还款日（含）前还清上期账单最低还款额，那么将按最低还款额未还部分的5%计收违约金，最低收取人民币10元或美金1元。所以，如果您的信用卡逾期2天且未还最低还款额，那么除了罚息外，还可能产生违约金。

综上所述，农行信用卡逾期2天是会扣取相关费用的，包括逾期罚息和可能的违约金。为了避免这些额外的费用，建议您尽量在到期还款日前还清信用卡欠款，或者至少还清最低还款额。如果确实因为某些原因无法按时还款，也应尽快与银行联系，了解相关的还款宽限政策和费用减免政策。