汽车被建设单位淹水后，可以主张折旧费赔偿，但具体能否获得赔偿需根据实际情况分析。

首先，我们要明确汽车被淹水是否属于建设单位的责任。如果建设单位在施工过程中，由于管理不善、未采取合理措施等原因，导致汽车被淹水，那么建设单位应当承担相应的赔偿责任。

关于折旧费的赔偿，这通常涉及到对汽车价值的评估。一般来说，汽车被淹水后，其性能、外观等方面都可能受到影响，从而导致价值降低。因此，在主张折旧费赔偿时，你需要提供相关的评估报告或证明，以证明汽车的价值确实因为淹水而降低。

具体来说，你可以按照以下步骤来主张赔偿：

1. 收集证据：包括汽车被淹水的照片、视频、建设单位的相关施工记录等，以证明汽车被淹水的事实以及建设单位的责任。

2. 评估汽车价值：联系专业的评估机构或汽车经销商，对汽车进行价值评估，并出具评估报告。这份报告将作为你主张折旧费赔偿的重要依据。

3. 与建设单位协商：将收集到的证据和评估报告提交给建设单位，并与其进行协商，要求其承担折旧费赔偿责任。

4. 法律途径：如果协商无果，你可以通过法律途径来维护自己的权益。例如，向法院提起诉讼，要求建设单位赔偿汽车折旧费等相关损失。

需要注意的是，具体的赔偿金额和赔偿方式可能因案件具体情况而有所不同。因此，在处理此类纠纷时，建议你保持冷静、理性，并寻求专业律师的帮助，以确保自己的权益得到充分保障。如果你有任何疑问或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。