在补缴社保的过程中，最怕的三个证据问题主要涉及到伪造材料、虚假劳动关系以及缺乏实质性证据，这些问题都可能导致补缴申请被拒绝，甚至可能面临法律责任。以下是对这三个问题的详细解析：

一、伪造材料

伪造材料是补缴社保中最严重的问题之一。这包括伪造工资表、劳动合同书、补缴人员名册等，以虚构劳动关系或篡改缴费记录。根据《中华人民共和国社会保险法》的相关规定，以欺诈、伪造证明材料或者其他手段骗取社会保险待遇的，不仅会被责令退回骗取的社会保险金，还会面临骗取金额二倍以上五倍以下的罚款。更严重的是，如果构成诈骗罪，还将依法追究刑事责任。因此，在补缴社保时，务必确保提供的所有材料都是真实、合法的。

二、虚假劳动关系

虚假劳动关系也是补缴社保中常见的问题。有些人为了补缴社保，可能会与他人或企业串通，虚构劳动关系。然而，这种虚假劳动关系是很容易被查实的。社保部门在审核补缴申请时，会严格审查劳动关系的真实性，包括劳动合同的签订、工资的发放、税收的缴纳等方面。如果无法提供充分的证据证明劳动关系的真实性，那么补缴申请很可能会被拒绝。此外，像案例中提到的那样，即使通过虚假劳动关系成功补缴了社保，也可能面临被追回已领取的社会保险待遇和法律责任的风险。

三、缺乏实质性证据

在补缴社保的过程中，如果缺乏实质性证据来证明劳动关系的存在和缴费的合理性，那么申请也很可能会被拒绝。实质性证据包括劳动合同、工资单、税收缴纳证明等能够直接证明劳动关系和缴费情况的材料。如果无法提供这些材料，或者提供的材料不足以证明劳动关系的实际履行情况，那么社保部门可能会认为申请不符合补缴条件而予以拒绝。因此，在申请补缴社保前，务必准备好充分的实质性证据来支持自己的申请。

综上所述，补缴社保时最怕的三个证据问题是伪造材料、虚假劳动关系以及缺乏实质性证据。为了避免这些问题，建议在申请补缴社保前仔细了解相关规定和要求，并准备好真实、合法的材料和充分的实质性证据来支持自己的申请。