关于公司三年社保补缴的流程，具体步骤和要求可能会因地区而异。但一般来说，以下是一个较为通用的流程指南，同时我会结合上海市和佛山市的具体规定来为您详细解答。

一、补缴条件与范围

首先，需要明确补缴的条件和范围。通常，单位需要为未及时申报缴纳社会保险费的员工，或因劳动仲裁、劳动监察、法院调解或裁决需要补缴社会保险费的员工，进行社保补缴。同时，补缴的时段和溯及时间也有具体规定，如佛山市规定补缴时段可从建立劳动关系之月起计算，且最早不超过当地贯彻国家和省相关法律、法规和政策的实施时间。

二、准备申请材料

接下来，单位需要准备相关的申请材料。这些材料可能包括但不限于：

• 补缴申请（需说明补缴原因、补缴时段等）
• 录用材料或劳动合同（证明劳动关系）
• 法律文书（如劳动仲裁裁决书、法院调解书等，如有）
• 职工本人工资证明材料（用于确定补缴基数）

请注意，申请材料的具体要求可能因地区而异，建议提前咨询当地社保部门或税务部门以获取准确信息。

三、提交申请与审核

单位需将准备好的申请材料提交至当地社保中心或税务部门进行审核。在上海市，单位可以向市社保中心各分中心申请，各分中心会当场受理，并在规定期限内审核、操作、反馈办理结果。审核过程中，如果材料不齐全或不符合要求，相关部门会当面告知，单位需按要求补充或修改材料后重新提交。

四、缴纳费用

审核通过后，单位需要按照核定的补缴金额进行缴纳。这通常包括补缴的本金、利息和滞纳金（如有）。在佛山市，税务部门负责征收应补缴金额，并会告知用人单位和个人有关法律责任、义务和权益。

五、办理完成与反馈

缴纳费用后，相关部门会出具办理完成的证明或反馈结果。单位需妥善保管这些证明文件，以备后续查询或使用。

注意事项

1. 补缴时段内的待遇：请注意，补缴时段内的某些社保待遇（如基本医疗保险基金支付的基本医保待遇、生育保险待遇等）可能不予支付。具体规定请咨询当地社保部门。
2. 及时性与准确性：社保补缴涉及员工的切身利益，单位应确保及时、准确地完成补缴手续，避免因延误或错误导致不必要的纠纷或损失。
3. 政策变化：社保政策可能会随着时间和地区的变化而有所调整。建议单位定期关注当地社保部门的通知和公告，以确保及时了解并遵守最新的政策规定。

综上所述，公司三年社保补缴的流程包括明确补缴条件与范围、准备申请材料、提交申请与审核、缴纳费用以及办理完成与反馈等步骤。在具体操作时，请务必遵循当地社保部门或税务部门的指导和要求。