您好，关于公司自然人股权转让需要缴纳的税种，我为您整理了以下详细信息：

首先，自然人股权转让主要涉及以下几种税：

1. 个人所得税：

   • 税率：固定的20%。
   • 计税依据：股权转让价减去股权取得初始成本，再减去与转让股权相关的合理费用（如印花税、公证费等）。
   • 注意事项：个人所得税的纳税主体是股权转让方，但受让方需作为转让方的代扣代缴义务人。

2. 印花税：

   • 税率：万分之五（0.5‰）。
   • 计税依据：双方书立的合同金额。
   • 注意事项：印花税的纳税主体是转让方和受让方双方，股权转让合同或协议必须贴花缴纳印花税。

此外，虽然增值税和企业所得税在股权转让中也可能涉及，但通常不适用于自然人股权转让。增值税主要针对货物和服务的销售，而企业所得税则是针对企业作为持股主体转让股权时需要缴纳的。

在办理股权转让时，您还需要注意以下几点：

1. 办理部门：股权转让需要到工商部门办理，提交变更登记申请书、转让的主体资格证明等材料。

2. 法律程序：转让股权需要召开新股东会议，经过新股东会表决同意，并任命新股东的相关职务。同时，需要讨论新的公司章程，并在通过后签字盖章。

3. 税务处理：股权交易各方在签订股权转让协议并完成股权转让交易后，至企业变更股权登记之前，负有纳税义务或代扣代缴义务的转让方或受让方，应到主管税务机关办理纳税（扣缴）申报，并持税务机关开具的股权转让所得缴纳个人所得税完税凭证或免税、不征税证明，到工商行政管理部门办理股权变更登记手续。

综上所述，自然人股权转让主要需要缴纳个人所得税和印花税。在办理过程中，请务必遵守相关法律法规和税务规定，确保合法合规地完成股权转让。如有任何疑问或需要进一步的帮助，请随时咨询相关部门或专业人士。