部队住房补贴的计算方式主要依据的是《进一步深化军队住房制度改革方案》以及后续的相关补充规定。以下是对部队住房补贴计算方式的详细解释：
一、基本补贴额的计算
基本补贴额是一次性算清的，其计算公式为：
基本补贴额 = 1999年12月份基本工资 × 40.94% × 1999年12月(含)前的工作月份之和 + 每平方米每年8元 × 1992年6月30日前的军(工)龄 × 购房补贴建筑面积标准
其中，购房补贴建筑面积标准根据军官的职级有所不同，具体如下：
正、副军职军官的补贴面积标准暂按180平方米、165平方米计算。文职干部则参照相应职级军官的补贴面积标准计算。士官的补贴面积标准也根据军(工)龄有所不同。
二、地区补贴
地区补贴在经批准购买住房时计算，具体数额和计算方式可能因地区而异，需根据当地的相关规定执行。
三、购房未达标的货币补差
对于已购买现有住房、安居工程住房和参加集资建房的军队人员，如果购房实际建筑面积未达到购房补贴建筑面积标准，将不予退房，而是给予货币补差。具体补差办法由总后勤部根据国家的有关规定另行制定。
四、住房补贴资金来源与分配
住房补贴资金来源于国家划拨的房改资金、原有住房建设资金转化、现有住房出售收入以及利用军用空余土地自建经济适用住房的用地折款等。住房补贴资金实行指标控制，由总后勤部根据资金筹措数量、住房需求和房价等情况，按照重点保障转业和离退休人员、优先安排资历较长和在艰苦边远地区工作人员的原则下达年度指标。
五、特殊情况说明
综上所述，部队住房补贴的计算方式涉及多个因素，包括基本工资、工作月份、军(工)龄、购房补贴建筑面积标准以及地区补贴等。在具体计算时，需根据个人的实际情况和当地的相关规定进行确定。