企业退税有可能会被查账，但这并不是必然的。是否查账取决于多种因素，以下是对此情况的全面分析：
可能会查账的情况：
- 退税金额较大：当企业申请的退税金额较大时，税务机关可能会对企业的财务状况进行更为细致的审查，以确保退税的合理性和准确性。
- 数据异常或存在疑点：如果企业的退税申请数据与以往纳税申报数据存在较大差异，或者税务机关在审核过程中发现其他异常或疑点，也可能会触发查账程序。
- 过往纳税信用不佳：对于纳税信用记录不佳的企业，税务机关在退税审核时可能会更加谨慎，通过查账来核实企业的退税申请是否合法合规。
不一定会查账的情况：
- 退税金额较小且资料齐全：如果企业申请的退税金额相对较小，并且提供的退税申请材料完整、准确，税务机关可能会仅进行形式审核，而不会进行深入查账。
- 企业纳税信用良好：对于纳税信用记录良好的企业，税务机关在退税审核时可能会给予更多的信任，从而减少查账的可能性。
此外，还需要注意的是，不同地区的税务机关在退税审核方面的具体做法可能会有所不同。因此，企业在申请退税前，最好先咨询当地税务机关的具体要求和流程。
综上所述，企业退税是否会被查账取决于多种因素，包括退税金额、数据异常、纳税信用记录以及地区差异等。企业应确保自身的税收申报合法合规，以避免不必要的风险和麻烦。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。