残疾人两项补贴追缴的主管部门主要是各地的民政部门，具体执行则由乡镇（街道）负责。

在残疾人两项补贴的管理中，民政部门和残联扮演着重要的角色。民政部门主要负责补贴的发放和管理，包括比对残疾人的经济状况变化情况，决定是否停发补贴以及是否需要追缴资金。残联则负责比对残疾人的证件状态，协助民政部门进行数据比对和动态复核。

当在数据比对和动态复核中发现不符合补贴条件的情形时，民政部门会及时停止补贴发放，并通知乡镇（街道）进行资金追缴。乡镇（街道）一般应在3个月内完成资金追缴工作，并将追缴信息录入全国残疾人两项补贴信息系统，上传退款凭证。

此外，值得注意的是，在整个数据共享、信息比对和资金追缴的过程中，各级民政部门和残联都非常注重保护残疾人的隐私和数据安全，会采取一系列措施确保数据的安全性和隐私性。

总的来说，残疾人两项补贴追缴的主管部门是民政部门，具体执行由乡镇（街道）负责，残联等其他相关部门则提供必要的协助和支持。