当京东快递把退货商品丢失时，赔偿的处理方式主要依据快件是否保价、以及具体的丢失情况来确定。以下是详细的赔偿规则及流程：

一、保价快件赔偿规则

1. 保价费：按保价金额的2%计收。
2. 赔偿标准：
   • 若快件发生丢失，京东将按照被保价金额进行全额赔偿，但保价最高限额为每票人民币1万元整。
   • 购买了“全额保”服务的用户，快递丢失后可以享受优先处理，并提供商品价值证明，最快可在24小时内获得赔付。

二、未保价快件赔偿规则

对于未保价的退货商品，赔偿将按实际损失价值进行，但最高赔偿额通常不超过本次服务费用（不含其他附加费用）的若干倍，这个倍数可能因京东快递的具体规定而有所调整，一般在3-7倍之间。为了获得更合理的赔偿，用户可以与京东客服沟通，并提供物品购买凭证等证据来协商。

三、赔偿流程

1. 联系客服：发现退货商品丢失后，应尽快联系京东客服，并报告丢件情况。同时，保留好相关凭证，如快递单号、购买商品的发票或退货凭证等。
2. 提供证明：根据客服的要求，提供必要的证明文件，如购买记录、退货申请记录、价值证明等，以便京东对损失进行评估。
3. 等待处理：京东快递将根据赔偿规则对损失进行评估，并尽快给出赔偿方案。
4. 获得赔偿：用户同意赔偿方案后，京东快递将按照约定进行赔偿。赔偿款通常会以原支付路径返还，如退回至用户的支付账户。

四、其他注意事项

• 如果退货商品是在电商平台交易过程中丢失，且电商平台对退货快递有服务承诺或保障措施，用户也可以考虑向电商平台寻求赔偿或协助。
• 在整个赔偿过程中，用户应保持与京东客服的沟通畅通，及时提供所需信息，并耐心等待处理结果。

综上所述，当京东快递把退货商品丢失时，用户应根据快件是否保价以及具体丢失情况来选择合适的赔偿方式，并按照赔偿流程进行操作。在整个过程中，保留好相关凭证和与客服的沟通记录是非常重要的。