营业执照和商标注册并不是一起办理的，它们是两个不同的概念，分别具有不同的功能和办理流程。

首先，营业执照是企业、个体工商户等市场主体准许从事营利性经营活动的凭证。它由登记机关依法登记后颁发，表明主体具有合法经营资格，并确立了市场主体的经营身份和范围。简言之，营业执照是开展经营活动的“门槛”，没有它就无法合法地进行经营活动。

而商标注册则是对商标进行保护的法律程序。商标是用于区别商品或服务来源的标志，经注册后，商标所有者获得专用权，受法律保护。这意味着，只有注册了商标，才能防止他人在相同或类似商品、服务上使用相同或近似商标造成混淆，从而保障品牌的独特性和市场竞争力。

因此，营业执照和商标注册虽然都是企业在经营过程中需要关注的重要事项，但它们并不是一回事，也不是一起办理的。企业需要先办理营业执照，获得合法经营资格后，再根据需要考虑是否进行商标注册，以保护自己的品牌权益。

希望这个解答能够帮助您清晰地理解营业执照和商标注册的区别和办理流程。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。