对于双重户口的合法处理，首先需要明确的是，双重户口是指一个人同时拥有两个或两个以上的户口。这种情况在我国是不被允许的，因为根据相关法律法规，每个公民只能拥有一个合法的户口。

处理双重户口的基本原则是：经公安机关调查核实的真实户口应予以保留，而虚假户口或重复户口则应予以注销。具体来说，如果是迁移后未注销的重复户口，应注销后来的户口；如果是二次以上重复迁移的户口，应保留第一次迁移的户口，其后迁移的户口应予以注销。

在处理流程上，公安机关会根据重复（虚假）户口线索开展详细的调查核实工作。这包括核实户口的真实性、来源以及是否存在弄虚作假等情况。一旦核实为重复（虚假）户口，公安机关会制发《重复（虚假）户口处理告知书》，通知当事人在规定时间内到公安机关办理户口注销手续。如果无法联系到当事人或当事人拒不签收告知书，公安机关会制发《重复（虚假）户口处理公告》，公告期满后，当事人仍未到公安机关办理注销手续的，公安机关将按规定注销重复（虚假）户口。

值得注意的是，有一些特殊情况下，双重户口的处理可能会根据群众意愿来选择保留哪一个户口。例如，因历史原因、婚嫁、子女在父母双方户口所在地均登记户口、民间事实收养、计划生育政策、大中专院校上学或应征入伍等原因造成的重复户口，在排除冒名顶替、弄虚作假情形后，如果重复户口来历清晰且注销户口不至于造成严重后果的，可以根据群众意愿选择其中之一作为保留户口。

最后，如果当事人对公安机关注销户口的处理不服，可以在规定时间内向注销户口的公安机关的上级公安机关或者同级人民政府申请行政复议，或者在六个月内依法向同级人民法院提起行政诉讼。

综上所述，处理双重户口需要遵循相关法律法规和政策文件的规定，根据具体情况进行调查核实和处理。如果您发现自己或他人存在双重户口的情况，请及时与当地公安机关联系并配合处理。