农保（农村合作医疗）与医保（职工医保或城乡居民医保）的报销比例确实存在区别，这主要体现在报销的比例、起付标准以及不同级别医疗机构的报销政策上。以下是对这两者的详细比较：

一、农村合作医疗（现已整合为城乡居民基本医疗保险）报销比例

1. 市内住院报销比例：

   • 三级医疗机构：65%
   • 二级医疗机构：75%
   • 一级及以下医疗机构：90%

2. 异地住院报销比例（符合规定转诊的，较本地比例下降10%）：

   • 三级医疗机构：50%
   • 二级医疗机构：60%
   • 一级及以下医疗机构：70%

3. 普通门诊报销比例：

   • 居民医保普通门诊不设起付标准，政策范围内医疗费用支付比例为55%（具体比例可能因地区而异）。

二、职工医保报销比例

1. 在职职工市内住院报销比例：

   • 三级医疗机构：88%
   • 二级医疗机构：90%
   • 一级及以下医疗机构：92%
   • 退休人员相应提高3%

2. 在职职工异地住院报销比例（符合规定转诊的，较本地比例下降10%）：

   • 三级医疗机构：68%
   • 二级医疗机构：70%
   • 一级及以下医疗机构：72%
   • 退休人员相应提高3%

3. 普通门诊报销比例：

   • 在职职工发生的政策范围内医疗费用，一级及以下医疗机构支付比例为85%，二级医疗机构为70%，三级医疗机构为55%。退休人员支付比例相应提高5%。

三、主要区别

1. 报销比例：职工医保的报销比例普遍高于城乡居民医保，尤其是在高级别医疗机构。
2. 起付标准：城乡居民医保和职工医保在住院报销时可能设有不同的起付标准，且职工医保的起付标准可能因退休状态而有所调整。
3. 门诊报销：两者在门诊报销的比例和设置上也可能存在差异，职工医保的门诊报销比例通常更高。

四、其他注意事项

• 报销比例和起付标准可能因地区、政策调整或特定疾病而有所变化。
• 城乡居民医保和职工医保在报销范围、报销流程等方面也可能存在差异。

综上所述，农保（农村合作医疗）与医保（职工医保）在报销比例上存在显著差异，这主要由两者的保障对象、缴费标准以及政策设计等因素决定。因此，在选择医保类型时，应根据自身情况和需求进行合理选择。