医保支付扣的钱主要来源于两个方面：医保统筹基金和个人账户。

首先，医保统筹基金支付的是属于医保目录范围内，按规定由基本医疗保险统筹基金支付的医疗费用，这部分不需要个人直接掏钱，是医保直接报销的部分。使用医保统筹支付，通常需要达到医保统筹地区的起付线标准，具体标准根据参加的医保类型（如职工医保、居民医保）以及医院级别的不同而有所差异。

其次，个人账户则用于支付医保目录范围内需要由患者个人负担的医疗费用，这部分费用包括起付线以下、乙类先行自付、按比例自付、封顶线以上以及目录范围内超限价部分等。当个人账户内的余额不足以支付这些费用时，个人需要用现金或其他方式支付。

总的来说，医保支付扣的钱既可能来自医保统筹基金，也可能来自个人账户，具体取决于医疗费用的性质以及个人医保账户的情况。在实际就医过程中，医保系统会自动计算并扣除相应的费用，个人只需关注最终需要支付的自费部分即可。