结论前置：C1驾驶证扣12分超过三年未处理，驾驶证很可能已被注销。需根据具体情况采取不同措施，若驾驶证确已被注销，则需重新报考驾校，通过全部科目考试后方可重新获得驾驶证。

详细分析：

1. 仅扣12分，未参加学习和考试：

   • 驾驶证在一个记分周期内被扣满12分后，驾驶人应在规定时间内参加学习并考试。若未在规定时间内处理，虽不会直接导致驾驶证注销，但期间不得驾驶机动车，否则将按无证驾驶处理。
   • 若超过三年仍未处理，驾驶人需先查询驾驶证状态，确认是否已被注销或处于停止使用状态。

2. 扣12分，且驾驶证已被公告停止使用：

   • 因未参加学习或考试，驾驶证被公告停止使用，且超过三年未处理，驾驶证很可能已被注销。
   • 驾驶人需先到车管所参加科目一学习和考试，考试合格后，若驾驶证在有效期内，可恢复驾驶资格；若超期但未满一年，可按正常流程换证；若超期三年以上，则驾驶证彻底注销，需重新考取。

3. 扣12分，且涉及酒驾等其他严重违法行为被吊销：

   • 因酒驾等严重违法行为导致扣12分并被吊销驾驶证，且已超过三年，禁驾期内不能重新考取驾驶证。
   • 需等待禁驾期结束，然后重新报名参加全部科目的考试（从科目一到科目四），考试合格后，可获得新的驾驶证。

建议与注意事项：

• 查询驾驶证状态：首先，应尽快查询自己的驾驶证当前状态，确认是否已被注销或处于停止使用状态。
• 咨询当地交管部门：由于具体规定可能因地而异，建议直接咨询当地的交通管理部门以获取最准确的信息和指导。
• 重新报考驾校：若驾驶证已被注销，需重新报考驾校，从科目一到科目四依次完成考试，全部合格后才可再次取得驾驶证。
• 及时处理：为避免不必要的麻烦和损失，驾驶人应及时处理扣分问题，按要求参加学习和考试。

综上所述，C1驾驶证扣12分超过三年未处理的情况较为复杂，需根据具体情形采取相应的措施。无论何种情况，都建议驾驶人积极面对并妥善处理，以确保自身的合法权益和驾驶资格得到有效保障。若您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。