在民事诉讼中发现有刑事犯罪行为时，是否提交刑事自诉状以及何时提交，需根据具体情况来分析。以下是我的详细解答：

1. 首先明确诉讼类型：

   • 民事诉讼主要处理平等主体之间的民事争议，如合同纠纷、侵权纠纷等。
   • 刑事诉讼则针对涉嫌犯罪的行为进行审理，包括公诉和自诉两种方式。公诉由检察机关提起，自诉则由被害人或其法定代理人、近亲属直接向法院提起。

2. 判断是否需要提交刑事自诉状：

   • 如果民事诉讼中发现的刑事犯罪行为属于“告诉才处理”的案件，如侮辱、诽谤、暴力干涉婚姻自由等，且符合自诉案件的其他条件（如被害人有证据证明、属于法院管辖等），则可以考虑提交刑事自诉状。
   • 如果该刑事犯罪行为不属于“告诉才处理”的案件，或者虽然属于但不符合自诉案件的其他条件，则应通过其他途径处理，如向公安机关报案。

3. 何时提交刑事自诉状：

   • 在决定提交刑事自诉状后，应尽快准备相关证据材料，并撰写自诉状。
   • 提交时机上，一般建议在民事诉讼进行到一定阶段，但尚未作出终审判决前提交。因为一旦民事诉讼作出终审判决，再提起刑事自诉可能会面临诸多程序上的障碍。
   • 同时，也应注意民事诉讼与刑事自诉的衔接问题，确保两者在程序上不会相互冲突。

4. 注意事项：

   • 提交刑事自诉状前，应仔细研究相关法律法规和司法解释，确保自诉状的合法性和有效性。
   • 准备好充分的证据材料，以支持自诉请求。
   • 如对刑事诉讼程序不熟悉，建议咨询专业律师以获取更详细的法律建议和指导。

综上所述，在民事诉讼中发现有刑事犯罪行为时，是否提交刑事自诉状以及何时提交需根据具体情况来判断。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。