应纳税所得额5万多，是否需要补缴税款，取决于具体的税务情况和税法规定。

1. 应纳税所得额的计算：应纳税所得额是计算个人所得税的基础，它是指纳税人按照税法规定，在一定时期内所获得的应税收入减去相关扣除后的余额。如果应纳税所得额为5万多，那么首先需要确认这个数额是否准确，是否已经扣除了所有合法的税前扣除项目，如基本费用、专项扣除、专项附加扣除等。

2. 税率的适用：个人所得税采用累进税率，应纳税所得额越高，适用的税率也越高。因此，需要查看5万多的应纳税所得额对应的税率，并据此计算应缴税额。

3. 已缴税额的核对：接下来，需要核对纳税人已经缴纳的税额。如果已缴税额少于应缴税额，那么就需要补缴税款；如果已缴税额多于应缴税额，则可能存在退税的情况。

4. 特殊情况的处理：在某些特殊情况下，如享受税收优惠、税收减免等，可能会影响应缴税额的计算。因此，需要查看是否存在这些特殊情况，并据此调整应缴税额。

综上所述，应纳税所得额5万多是否需要补缴税款，需要根据具体的税务情况和税法规定来确定。建议纳税人仔细核对自己的税务情况，如有疑问或不确定的地方，可以及时向我咨询，以确保税务处理的准确性和合规性。