美甲店将美容产品通过微针方式违规操作属于非法行医。

具体来说，根据《中华人民共和国医师法》及相关法规，未取得医师执业证书和医师资格证书的人员，不得从事医师执业活动，包括医疗美容行为。美甲店通常只具备提供美甲服务的资质，并不具备从事医疗美容活动的资格。如果美甲店擅自通过微针方式将美容产品导入消费者皮肤，这种行为就构成了非法行医。

此外，根据《化妆品监督管理条例》，化妆品只能外用于皮肤表面，不得用各种方式导入皮肤。能够导入皮肤的必须是“械字号”或“药准字号”产品。因此，美甲店使用化妆品进行微针治疗也是违法的。

如果消费者发现美甲店存在此类非法行医行为，可以向县级以上人民政府卫生健康主管部门举报，相关部门将依法对违法行为进行查处，包括责令停止非法执业活动、没收违法所得和药品、医疗器械，并处以罚款等行政处罚。

综上所述，美甲店将美容产品通过微针方式违规操作属于非法行医，消费者应提高警惕，选择正规的医美机构接受合法合规的医疗美容服务。如果遇到非法行医行为，应及时向相关部门举报以维护自己的合法权益。