结论：施工企业注册地和施工地点不一致时，一般应向施工行为地（即施工地点所在地）的人民法院提起诉讼。但具体还需根据合同约定及案件具体情况来判断。
详细分析：
一般原则：
- 根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，因合同纠纷提起的诉讼，由被告住所地或者合同履行地人民法院管辖。在建设工程合同中，施工行为地通常被视为合同履行地。
- 因此，当施工企业注册地和施工地点不一致时，如果双方没有特别的约定，原告通常可以选择向施工行为地（即施工地点所在地）的人民法院提起诉讼。
合同约定：
- 如果建设工程合同中明确约定了争议解决的方式和地点，比如约定了仲裁条款或者指定了特定的管辖法院，那么应当遵循合同中的约定。
- 在这种情况下，即使施工企业注册地和施工地点不一致，也需要按照合同中的约定来确定管辖法院或仲裁机构。
特殊情况：
- 如果建设工程合同涉及多个施工地点，或者施工行为地难以确定，那么可能需要根据案件的具体情况，结合相关法律规定和司法实践，来确定最合适的管辖法院。
- 另外，如果双方对管辖法院有争议，且无法通过协商解决，那么可能需要通过诉讼或仲裁等方式来确定最终的管辖法院。
法律建议：
- 在签订建设工程合同时，建议双方明确约定争议解决的方式和地点，以避免未来可能出现的管辖争议。
- 如果已经发生了管辖争议，建议及时咨询专业律师，根据案件的具体情况和相关法律规定，制定合适的诉讼策略。
可能后果：
- 如果选择了错误的管辖法院提起诉讼，可能会导致案件被驳回或者移送至有管辖权的法院，从而增加诉讼成本和时间成本。
- 因此，在选择管辖法院时，务必谨慎考虑，确保选择正确且有管辖权的法院。
如有任何进一步的问题或需要更详细的法律建议，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供针对性的解答。