公司扣员工绩效是否合法，主要取决于公司的绩效考核制度是否合理、公平、透明，并且是否按照劳动合同或相关规章制度严格执行。以下是对此问题的详细分析：
合法情况
有合理合法的考核制度：
- 公司应依法制定绩效考核制度，该制度需明确绩效考核的标准、计算方式及扣减情形，并经过民主程序制定（如职工代表大会讨论、与工会或职工代表平等协商等），同时向员工公示或告知。例如，公司规定销售人员需完成特定销售业绩才能获得全额绩效工资，且这一规定已在员工入职时通过员工手册等方式明确告知，那么这种扣减是合法的。
劳动合同中有明确约定：
- 劳动合同中应明确约定绩效工资的数额、发放条件及扣减办法。员工在签署合同时应知晓并同意这些条款。若合同中规定，若员工未完成某项关键任务，将扣减相应绩效工资，那么当员工确实未完成任务时，扣减行为是合法的。
扣除比例合法且未低于最低工资标准：
- 根据相关规定，因员工本人原因给公司造成经济损失的，可从其工资中扣除赔偿，但每月扣除部分不得超过员工当月工资的20%，且扣除后剩余工资不得低于当地月最低工资标准。这一原则同样适用于绩效工资的扣减。
不合法情况
缺乏制度依据或未经民主程序：
- 若公司没有制定绩效考核制度，或虽有制度但未经过民主程序制定，也未向员工公示，则随意扣减绩效工资是不合法的。
随意变更考核标准：
- 公司在考核过程中擅自变更考核标准，导致员工无法达到新标准而被扣绩效工资，这种行为是不合法的。考核标准应具有稳定性和可预测性，不能随意变动。
恶意扣减以变相降薪：
- 公司为降低员工工资而故意给予低绩效评价，从而扣减绩效工资，属于变相降薪，是不合法的。这种行为损害了员工的合法权益，违反了劳动法的相关规定。
制度显失公平或劳动合同中无约定：
- 若绩效考核制度本身存在重大漏洞或显失公平，或劳动合同中未约定绩效工资，则依据该制度或合同进行的扣减行为也是不合法的。
员工权益维护
若员工认为公司扣减绩效工资的行为不合法或存在争议，可采取以下措施维护自身权益：
与公司协商解决：首先尝试与公司沟通，了解扣减原因和依据，并表达个人意见和诉求。通过协商，双方可能达成一致意见，从而解决问题。
向劳动行政部门投诉：若协商无果，员工可向当地劳动行政部门投诉，寻求政府部门的帮助和支持。劳动行政部门将依法进行调查处理，维护员工的合法权益。
申请劳动仲裁或提起诉讼：若以上途径均无法解决问题，员工可向劳动仲裁机构申请仲裁或向人民法院提起诉讼。通过法律途径，员工可以维护自己的合法权益，并获得相应的法律救济。
总结来说，公司扣员工绩效是否合法取决于多种因素，包括是否有明确的绩效考核制度、制度是否合理公平透明、是否按照约定执行以及是否遵循了正当的考核程序等。员工在面对此类问题时，应了解自身权益，并在遭遇不公时采取适当措施维护自身权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。