结论：员工自离一般不影响上月工资的正常发放，但具体是否会影响及影响程度需根据公司的合法规定、劳动合同的具体条款以及是否给用人单位造成经济损失来确定。
法律依据与法理分析
基本法律原则：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这意味着，只要劳动者在上月提供了正常劳动，无论其后续是否选择自离，用人单位都应支付上月的全额工资。
- 《工资支付暂行规定》第九条也明确指出，劳动关系双方依法解除或终止劳动合同时，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者工资。这一规定进一步强调了工资支付的及时性和无条件性，与员工是否自离无直接关联。
特殊情况下的处理：
- 如果员工自离给用人单位造成了经济损失，根据《工资支付暂行规定》第十六条，用人单位可要求员工赔偿经济损失，并从其工资中扣除，但每月扣除部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后剩余工资不得低于当地月最低工资标准。需注意的是，这种扣除通常针对自离当月的工资，而不应影响上月已完成工作的工资支付。
- 此外，如果公司规章制度或劳动合同中有明确规定，自离员工需承担一定经济责任或罚款，且这些规定不违反法律法规的强制性规定，那么公司可能在一定程度上调整上月工资的发放，但这种情况较为少见，且需严格遵循法定程序。
公司规定与劳动合同的作用：
- 公司可在劳动合同或员工手册中明确规定对擅自离职员工的经济处罚措施，如扣发部分或全部工资、奖金等。然而，这些规定必须合法且合理，并且员工在入职时需签署并同意这些规定。若规定合法有效，公司在员工自离后按此执行具有法律依据，但仍需确保不违反《劳动法》和《工资支付暂行规定》中关于工资支付的基本原则。
实际操作建议
员工角度：
- 在离职前，员工应与公司的人力资源部门或法律顾问进行沟通，了解具体的法律规定和公司政策，以避免不必要的纠纷和损失。
- 如果用人单位以员工自离为由克扣上月工资，员工可以先尝试与用人单位协商解决；协商不成的，可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。
用人单位角度：
- 用人单位应制定合法合理的规章制度和劳动合同条款，明确员工离职时的工资支付、经济赔偿等事项，以减少纠纷和风险。
- 在处理员工自离事件时，用人单位应遵循法律法规的基本原则，确保工资支付的及时性和无条件性，同时依法追究因员工自离给公司造成的经济损失。
总结
员工自离是否影响上月工资的正常发放，需综合考虑法律规定、公司规定及劳动合同的具体条款。在大多数情况下，上月工资应正常发放，但员工也应注意遵守公司规定和劳动合同，避免给自己带来不必要的经济损失和法律风险。如果遇到相关问题，建议及时咨询专业律师以获取更具体的法律建议。