关于公积金贷第二天补扣是否算逾期的问题，这主要取决于当地公积金管理中心的具体规定。不过，我可以根据一些已知的信息，给您一个较为通用的解答。

首先，我们要明确的是，逾期贷款通常指的是借款人在约定的还款期限内没有按照合同约定的还款计划及时、足额偿还贷款本息。对于公积金贷款而言，如果借款人在约定还款日未能足额还款，但随后在规定时间内进行了补扣，是否算作逾期，这要看具体的补扣规则。

以保定市住房公积金管理中心为例，他们修改后的《住房公积金贷款逾期管理办法》中明确规定：借款人在约定还款日扣款未成功且于当日存入偿还贷款本息的，于次日补扣一次，补扣成功不计入逾期。这意味着，在保定市，如果借款人在还款日未能足额扣款，但在当天存入了足够的资金，且第二天补扣成功，那么这种情况是不会被视为逾期的。

而对于长春市住房公积金管理中心，虽然他们没有直接说明第二天补扣是否算逾期，但从他们的回复中可以推断，如果借款人在公积金贷款约定还款日未足额还款，只需及时将应还的差额资金存入公积金贷款约定还款卡中，中心会对未足额偿还部分资金进行补扣。这暗示了，只要及时补足并成功扣款，应该也不会被视为逾期。

综合以上信息，我们可以得出一个较为通用的结论：在大多数情况下，如果借款人在公积金贷款约定还款日未能足额还款，但在随后的一两天内及时存入了足够的资金，并且公积金管理中心成功进行了补扣，那么这种情况通常是不会被视为逾期的。不过，为了确保准确性，我建议您最好直接咨询您所在地的公积金管理中心，了解他们的具体规定和操作流程。

另外，为了避免不必要的麻烦和逾期风险，我建议您在每月还款日前确认还款卡内余额充足，确保能够按时足额还款。这样不仅可以避免逾期罚息和信用记录受损，还可以让您的贷款管理更加顺畅和安心。