收到询证函后的处理方式主要取决于询证函的来源和目的，但一般来说，可以遵循以下通用步骤进行处理，这里我以银行函证及回函工作为例进行详细说明：

一、确认询证函的真实性和合规性

1. 检查询证函格式：首先，需要确认询证函是否符合相关行业规范或标准格式，比如银行询证函应参照《银行函证及回函工作操作指引》中的格式。

2. 验证授权信息：确认询证函上是否有被审计单位（或相关授权方）的明确授权，以及授权是否真实有效。

3. 核对印章和签名：检查询证函上的印章和签名是否清晰、真实，并与预留印鉴或授权人签名进行比对。

二、查询和核对相关信息

1. 根据询证函内容查询：根据询证函上列明的具体事项，如账户余额、交易记录等，在内部系统中进行查询和核对。

2. 确保信息准确：在查询过程中，要确保所提供的信息准确无误，避免因信息错误导致的回函不实。

三、编制回函并审核

1. 编制回函：根据查询结果，按照询证函的格式要求，编制回函内容。回函应明确、具体，直接回答询证函上的问题。

2. 内部审核：回函编制完成后，应进行内部审核，确保回函内容真实、准确、完整，并符合相关法规和行业规范。

四、发送回函并跟踪

1. 发送回函：将审核通过的回函直接回复给询证方（如会计师事务所）或交付跟函的注册会计师。在采用纸质方式回函的情况下，原则上应在询证函原件上确认、填写相关信息并签章。

2. 跟踪回函情况：对于重要的询证函，可以跟踪回函的接收情况，确保询证方及时收到并确认回函内容。

五、特殊情况处理

1. 拒绝回函：如果询证函不符合规定或存在疑虑，如印章不清晰、授权不明确等，可以在规定时间内（如3个工作日内）通知询证方，并说明拒绝回函的原因。

2. 再次询证：如果回函内容存在不明确或需要进一步核实的情况，询证方可能会再次发出询证函。此时，应按照上述步骤重新进行处理。

六、记录和存档

1. 记录处理过程：对询证函的处理过程进行详细记录，包括接收时间、查询内容、回函编制和审核情况等。

2. 存档备查：将询证函、回函及相关处理记录进行存档备查，以备未来审计或检查之需。

针对非银行询证函的处理

如果询证函并非来自银行，而是来自其他机构或个人，处理流程可能略有不同，但基本原则相似。关键是要确认询证函的真实性和合规性，查询和核对相关信息，编制并审核回函，然后发送回函并跟踪情况。同时，也要做好记录和存档工作。

希望以上解答能对您有所帮助。如果您在处理询证函过程中遇到任何具体问题或需要进一步的指导，请随时提问。