结论：物业对业主种植的树木是否有清除权，需根据树木的种植位置、是否违反相关规定以及是否损害公共利益或他人权益来综合判断。具体来说：
有权清除的情况：
- 违反规定种植：如果业主未经许可，在小区公共区域（如消防通道、公共绿地等）种植树木，且该行为违反了小区管理规约、物业服务合同或相关法律法规，物业在履行一定告知程序后，有权进行清除。例如，若小区管理规约明确禁止在公共区域种植树木，而业主仍擅自种植，物业则有权依据规约进行清除。
- 损害公共利益：若业主种植的树木严重影响了小区公共安全或整体景观秩序，如遮挡消防通道、影响其他业主采光等，物业同样有权在履行告知程序后进行清除。
无权擅自清除的情况：
- 合法种植：如果业主在自家合法拥有的专属空间（如别墅庭院等）内种植树木，且该行为没有违反任何管理规约、法律法规，也没有影响小区的整体安全和公共利益，那么物业一般无权擅自清除这些树木。此时，物业应尊重业主的合法权益，不得随意干涉。
特殊情况的处理：
- 协商与沟通：即使树木种植未直接违反规定，但如果对其他业主造成了挡光、安全隐患等问题，物业可以介入协调，建议业主进行修剪或移植。在此过程中，物业应充分听取业主的意见，并寻求双方都能接受的解决方案。例如，若某业主种植的树木遮挡了相邻业主的窗户，物业可以组织双方进行协商，寻求合理的解决方案。
- 依据小区规定处理：如果小区的管理规约中明确规定了业主不得私自种植树木或对种植树木有严格规范要求，而业主违反了这些规定，物业则有权依据相关约定采取措施清除树木。但在此之前，物业仍需履行告知义务，并与业主进行沟通，确保程序的合法性和合理性。
法律责任与救济途径：
- 如果物业未经合法程序擅自清除业主种的树木，业主有权要求物业承担相应赔偿责任。赔偿范围包括树木本身的价值以及因树木被清除给业主造成的其他合理损失。例如，若物业未经业主同意擅自清除了业主种植的珍贵树种，业主可以要求物业赔偿树木的价值以及因树木被清除导致的其他损失。
- 双方应先尝试通过协商解决纠纷。如果协商不成，业主可以向当地房地产管理部门投诉或向法院提起诉讼来维护自己的合法权益。在诉讼过程中，业主需要提供充分的证据证明物业的行为违法或违约，以及自己因此遭受的损失。
建议：
- 作为业主，在种植树木前应先了解小区的管理规约和物业服务合同中的相关规定，确保自己的种植行为合法合规。
- 作为物业，在处理业主种植树木的问题时，应遵守相关法律法规和管理规约，充分尊重业主的合法权益，并通过协商与沟通寻求最佳解决方案。若需清除树木，应确保程序的合法性和合理性，避免引发不必要的纠纷。
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