员工加班后公司给予调休，在符合法定条件的情况下是合法的。以下从不同角度为你详细分析：

法定依据与条件

根据《劳动法》第四十四条的规定，有下列情形之一的，用人单位应当按照下列标准支付高于劳动者正常工作时间工资的工资报酬：

1. 安排劳动者延长工作时间的，支付不低于工资的百分之一百五十的工资报酬；
2. 休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，支付不低于工资的百分之二百的工资报酬；
3. 法定休假日安排劳动者工作的，支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。

从上述规定可以看出，对于休息日加班，用人单位可以优先安排补休（即调休），只有在无法安排补休的情况下，才需要支付不低于工资的百分之二百的工资报酬。因此，如果公司是在休息日安排员工加班，并且之后安排了调休，那么这种做法是合法的。

特殊情况分析

1. 工作日加班：如果员工是在工作日加班，即超出正常工作时间的部分，根据法律规定，公司应当支付不低于工资的百分之一百五十的工资报酬，而不能通过调休来替代。因为工作日加班涉及到的是劳动者正常工作时间的延长，与休息日加班的性质不同。

2. 法定节假日加班：对于法定节假日加班，公司必须支付不低于工资的百分之三百的工资报酬，同样不能通过调休来替代。法定节假日是劳动者依法享受的休息时间，加班应当得到更高的补偿。

实际操作建议

1. 明确加班性质：公司在安排员工加班时，应当明确加班的性质（是工作日加班、休息日加班还是法定节假日加班），并根据不同性质采取相应的补偿措施。

2. 完善调休制度：如果公司选择通过调休来补偿员工休息日的加班，应当确保调休制度的公平性和合理性，避免出现调休不足或调休不合理的情况。

3. 保留相关证据：员工在加班和调休过程中，应当保留好相关证据（如加班记录、调休通知等），以便在发生纠纷时维护自己的合法权益。

法律后果

如果公司违反法律规定，未按照法定标准支付加班工资或未安排调休，员工有权向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，要求公司支付相应的加班工资和赔偿金。

总结来说，员工加班后公司给予调休在符合法定条件（即休息日加班且之后安排了调休）的情况下是合法的。但如果是在工作日或法定节假日加班，则不能通过调休来替代加班工资。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。