关于第三方公司代缴社保的合法性，这确实是一个涉及多个法律层面的复杂问题，需要具体分析。
首先，我们来看合法情形：
合规的人事代理：如果企业在外地设有分支机构，且该分支机构不具备当地社保缴纳主体资格，那么企业可以通过合法注册且具备相应资质的人事代理机构，以分支机构的名义为员工在当地缴纳社保。这种做法在代理机构资质合法、操作流程合规的前提下，是被视为合法的人事管理方式。
临时性、短期性代缴：在企业新成立且社保开户手续尚在办理中的特殊情况下，为了不影响员工的社保权益，企业可以临时委托有资质的第三方机构代缴社保。但这种安排必须是短期的、合理的，并且在企业社保开户完成后应及时转为正常缴纳。
正规协议保障：企业与第三方代缴机构之间应签订正规的书面协议，明确双方的权利和义务，包括代缴的具体内容、费用、期限以及违约责任等。这有助于确保代缴行为的合法性和规范性。
接下来，我们分析不合法情形及潜在风险：
违反社会保险登记规定：如果企业通过第三方代缴社保，导致缴纳社保的单位与实际用工单位不一致，可能违反社会保险登记规定，从而面临法律风险。
侵害劳动者权益：如果第三方代缴机构服务不规范或资金管理不善，可能导致员工社保权益受损，如社保断缴影响医保报销、购房资格、落户资格等。
面临行政处罚：若社保行政部门查实企业通过无资质或不合规的第三方代缴社保，企业可能面临责令限期改正、罚款等行政处罚，对企业的声誉和经济利益造成双重打击。
欺诈与违规行为：如果第三方代缴机构存在欺诈、违规行为，如虚构劳动关系、虚报缴费基数等，不仅可能导致企业被追究法律责任，还可能引发员工与企业之间的劳动争议。
综合建议：
企业在考虑是否通过第三方代缴社保时，应谨慎评估代缴机构的资质、信誉以及代缴行为的合规性。务必确保与员工之间存在真实的劳动关系，并严格按照相关法律法规的规定进行社保缴纳。如果确实需要委托第三方代缴社保，应选择信誉良好、具备合法资质的代理机构，并签订正规的书面协议以明确双方权利和义务。同时，企业应加强对代缴过程的监督和管理，确保员工的社保权益得到有效保障。在必要时，建议企业咨询专业律师或法律顾问的意见，以避免潜在的法律风险。