员工签保密协议是合法的，但前提是协议内容必须合法、合理，且不侵犯员工的合法权益。以下是对此问题的详细分析：
法律依据
- 《中华人民共和国劳动法》第二十二条：明确劳动合同当事人可以在劳动合同中约定保守用人单位商业秘密的有关事项。
- 《中华人民共和国劳动合同法》第二十三条：详细规定用人单位与劳动者可以在劳动合同中约定保守用人单位的商业秘密和与知识产权相关的保密事项。对负有保密义务的劳动者，用人单位可以在劳动合同或者保密协议中与劳动者约定竞业限制条款，并约定在解除或者终止劳动合同后，在竞业限制期限内按月给予劳动者经济补偿。劳动者违反竞业限制约定的，应当按照约定向用人单位支付违约金。
保密协议的合法性与合理性
- 明确保密范围：保密协议应清晰界定哪些信息属于保密范畴，如客户名单、产品研发资料、未公开的财务数据等，避免模糊宽泛的表述。
- 合理的保密期限：保密期限应根据商业秘密的性质和行业惯例设定，不能过长到不合理的程度，通常几年到十几年不等，以确保既保护企业利益又不损害员工权益。
- 支付保密补偿（针对竞业限制条款）：若保密协议中包含竞业限制条款，公司应在竞业限制期限内按月给予员工经济补偿。未约定补偿的，竞业限制条款可能不被法律支持。但需要注意的是，普通的保密协议，并未强制要求用人单位支付保密费。
- 不违反法律法规：保密协议的内容必须遵守国家法律法规的强制性规定，不得侵犯员工的合法权益，如隐私权、劳动权等。
员工的权利与义务
权利：
- 员工在签订保密协议前，有权了解并审阅协议的全部内容，确保条款的合法性和合理性。
- 如发现协议存在违法或不合理的部分，员工有权拒绝签订，并可寻求法律援助或咨询。
义务：
- 一旦签订保密协议，员工需严格遵守保密义务，防止商业秘密泄露。
- 如违反保密协议，员工可能需承担违约责任，甚至面临民事责任或刑事责任的追究。
实际应用与建议
公司角度：
- 在制定保密协议时，应确保协议内容合法、合理，明确保密范围、保密期限以及违约责任等关键条款。
- 如需包含竞业限制条款，应明确约定经济补偿的标准和支付方式，以避免未来产生纠纷。
员工角度：
- 在签订保密协议前，应仔细阅读协议条款，确保自己充分理解并同意协议内容。
- 如对协议条款存在疑问或异议，应及时与公司沟通并寻求法律援助或咨询，以保护自己的合法权益。
综上所述，员工签保密协议是合法的，但前提是协议内容必须合法、合理，且不侵犯员工的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。