针对您提出的“两个法院查封同一不动产怎么处理”的问题，以下是我为您提供的详细解答：

当两个或两个以上的人民法院对同一不动产进行查封时，根据《不动产登记暂行条例实施细则》的相关规定，不动产登记机构会遵循特定的处理原则。具体来说：

1. 首封优先原则：

   • 不动产登记机构会首先为先送达协助执行通知书的人民法院办理查封登记，这被称为“首封”。
   • 首封法院对查封的不动产享有优先处置权，即在后续的执行程序中，首封法院有权首先对不动产进行拍卖、变卖等处置措施。

2. 轮候查封制度：

   • 对于后送达协助执行通知书的人民法院，不动产登记机构会为其办理轮候查封登记。
   • 轮候查封的顺序按照人民法院协助执行通知书送达不动产登记机构的时间先后进行排列。
   • 如果首封法院在查封期间解除查封，或者查封期限届满且未续封，那么轮候查封中排在首位的法院将自动升序为首封法院，享有优先处置权。

3. 查封期限的计算：

   • 以您提供的例子为例，如果甲房产被A法院于2016年8月1日查封，查封期限为三年，B法院于8月5日送达协助执行通知书要求办理查封登记。
   • 在A法院查封期间内，B法院的查封为轮候查封。若A法院未解除查封，B法院的查封期间应从A法院查封期限届满后的次日（即2019年8月1日）起算。
   • 若A法院在查封期间解除查封，B法院则升序为首封法院，查封期间从A法院解封之日起算。

4. 查封的效力：

   • 查封期间，不动产的权利人（即被执行人）对不动产的处分权受到限制，不得办理转移、抵押等手续。
   • 查封的目的是为了保障债权人的合法权益，确保在执行程序中能够顺利对不动产进行处置以偿还债务。

5. 多个法院查封的协调：

   • 在实际执行过程中，多个法院之间可能会就查封不动产的处置问题进行协调，以避免重复执行或执行冲突。
   • 协调的方式可能包括协商确定处置顺序、共同委托评估拍卖机构等。

综上所述，当两个法院查封同一不动产时，不动产登记机构会按照首封优先原则和轮候查封制度进行处理，并确保查封期限的正确计算。同时，多个法院之间也会就查封不动产的处置问题进行协调，以保障执行程序的顺利进行。希望这个解答能够帮助您更好地理解相关问题。