面对村干部扣留农民种地补贴款这一违法行为，您应当积极采取措施来维护自己的合法权益。以下是一些详细且具有深度的建议，希望能对您有所帮助：

一、明确行为性质与初步应对

首先，要明确村干部扣留种地补贴款是违法的，这侵犯了您的合法权益。在发现此类情况时，您可以先尝试与村干部进行友好协商，明确指出其行为的不当之处，并要求返还被扣留的补贴款。在协商过程中，建议您保留好相关的书面证据或录音，以备后续需要。

二、全面收集证据

为了更有效地维护自己的权益，您需要全面收集相关证据：

1. 政府文件：搜集关于种地补贴的官方文件，如补贴政策、发放标准等，以明确自己应得的补贴数额和依据。
2. 交易记录：检查涉及补贴款发放的银行转账记录、存单或收据等，寻找异常收支情况。如果补贴款是现金发放，尽量找到目击证人以支持您的主张。
3. 沟通记录：留存与村干部就补贴款问题沟通的聊天记录、通话录音等，这些可能包含关键信息，有助于证明您的权益受到了侵害。

三、内部反映与举报

在收集到足够证据后，您可以采取以下内部反映与举报措施：

1. 向村委会反映：组织相关村民，以书面形式向村委会提出诉求，要求其对扣留补贴款的情况进行说明和处理。
2. 向上级政府反映：若村委会未能给出满意答复，您可以将详细情况实名向上级乡镇政府的相关部门（如农业农村办公室、财政所、信访办）反映，请求他们介入调查并解决问题。
3. 纪检监察举报：向当地的纪检监察部门进行举报，提供详细的证据材料，以便相关部门进行调查核实并采取相应处理措施。

四、法律途径维权

如果内部反映与举报未能解决问题，您可以考虑通过法律途径来维权：

1. 行政复议与行政诉讼：若政府部门在补贴款发放中存在不作为或乱作为，您可以向其上级行政机关申请行政复议；对复议结果不满时，可在规定期限内向人民法院提起行政诉讼。
2. 民事诉讼：作为土地权益的主体，您在有充分证据的情况下，可向当地人民法院提起民事诉讼，要求村干部返还被扣留的补贴款并赔偿损失。
3. 刑事报案：若村干部的行为涉嫌贪污、侵占等刑事犯罪，您可向当地公安机关报案，请求立案侦查并追究相关人员刑事责任。

五、借助外部力量

除了上述措施外，您还可以借助外部力量来维护自己的权益：

1. 媒体曝光：通过正规媒体反映情况，借助媒体力量对扣留行为进行曝光，引起社会关注，促使相关部门重视并解决问题。
2. 网络监督平台：利用当地政府政务网络平台、纪检监察举报网站等渠道，实名举报村干部的违法违规行为，并上传相关证据材料。

六、总结与建议

面对村干部扣留农民种地补贴款的情况，您应当勇敢站出来维护自己的合法权益。通过全面收集证据、内部反映与举报、法律途径维权以及借助外部力量等多种方式，您可以有效制止这种违法行为并保护自己的切身利益。在此过程中，如果您感到困惑或需要更具体的法律建议，咨询专业律师将是一个明智的选择。他们能够提供更专业的指导，帮助您更好地维护自己的权益。