工作未满三个月离职扣工资是否合法，需分情况讨论：
若劳动合同或公司规章制度中有明确规定，且规定合法合理：
- 一般来说，如果劳动合同或公司规章制度中明确规定了员工在未满一定期限（如三个月）离职时，公司有权扣除一定比例的工资作为违约金或补偿，并且这一规定不违反法律法规的强制性规定，那么这种扣除可能是合法的。但需要注意的是，根据《劳动合同法》的规定，用人单位与劳动者约定的违约金仅限于服务期和竞业限制两种情形。因此，如果公司以员工未满三个月离职为由扣除工资，且该扣除不属于上述两种情形，那么这种扣除可能是不合法的。
- 此外，即使劳动合同或公司规章制度中有相关规定，但如果扣除的工资比例过高，或者扣除的理由不合理（如员工因个人原因离职，但公司却以“给公司造成损失”为由扣除工资），那么这种扣除也可能被视为不合法。
若劳动合同或公司规章制度中无明确规定，或规定不合法：
- 如果劳动合同或公司规章制度中没有明确规定员工在未满三个月离职时需要扣除工资，或者规定本身不合法（如违反了《劳动合同法》中关于违约金的规定），那么公司无权扣除员工的工资。
- 在这种情况下，如果公司仍然扣除了员工的工资，员工有权向公司提出异议，并要求公司补发被扣除的工资。如果公司拒绝补发，员工可以向当地劳动监察部门投诉，或者通过劳动仲裁、诉讼等法律途径维护自己的合法权益。
法律建议：
- 对于员工而言，在签订劳动合同时，应仔细阅读合同条款，特别是关于工资、福利、离职等方面的规定，确保自己的权益得到保障。如果合同中有不明确或不合理的地方，应及时与公司沟通并协商修改。
- 如果员工在未满三个月离职时遇到公司扣除工资的情况，应首先与公司沟通，了解扣除的原因和依据。如果认为扣除不合法或不合理，可以向公司提出异议，并要求公司补发被扣除的工资。
- 如果公司拒绝补发工资或员工对公司的处理结果不满意，可以向当地劳动监察部门投诉，或者通过劳动仲裁、诉讼等法律途径维护自己的合法权益。
可能法律后果：
- 如果公司非法扣除员工工资，可能会面临劳动监察部门的处罚，包括罚款、责令改正等。
- 员工也有权通过法律途径要求公司补发被扣除的工资，并可能获得相应的经济补偿或赔偿。
总之，工作未满三个月离职扣工资是否合法，需根据具体情况来判断。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。